Grâce au grimoire laissé par son grandpère mystérieusement disparu, le jeune Arthur découvre l'existence d'un monde invisible peuplé d'êtres minuscules appelés les Minimoys. Arthur est bien décidé à y suivre son grand-père et rencontrer ces créatures. Pour cela, une seule solution : rétrécir, et devenir lui-même un Minimoy...